Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f6O54917 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
E2f6O54917 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms