Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Efna3O08545 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna3O08545 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna3O08545 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna3O08545 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna3O08545 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna3O08545 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Efna3O08545 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms