Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tspan11Q9D1D1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tspan11Q9D1D1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan11Q9D1D1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms