Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc8a1P70414 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc8a1P70414 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms