Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL2P13500 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL2P13500 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL2P13500 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL2P13500 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL2P13500 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCL2P13500 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCL2P13500 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCL2P13500 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCL2P13500 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCL2P13500 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCL2P13500 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms