Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2f6O54917 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2f6O54917 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f6O54917 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2f6O54917 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
E2f6O54917 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f6O54917 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f6O54917 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
E2f6O54917 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms