Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gpc1Q9QZF2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpc1Q9QZF2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms