Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smco4Q9JIS3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Smco4Q9JIS3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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