Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atad2Q8CDM1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atad2Q8CDM1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms