Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ubqln3Q8C5U9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubqln3Q8C5U9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms