Protein–RNA interactions for Protein: Q12250

RPN5, 26S proteasome regulatory subunit RPN5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN5Q12250 JSN1YJR091C 3276 nt2.68□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 SIN3YOL004W 4611 nt2.68□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 TMA64YDR117C 1698 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 PCK1YKR097W 1650 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 YLR108CYLR108C 1458 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 ADY4YLR227C 1482 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 RSM28YDR494W 1086 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 ERP6YGL002W 651 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 TAD1YGL243W 1203 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 YGR115CYGR115C 780 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 ECI1YLR284C 843 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 SGT1YOR057W 1188 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 AFT2YPL202C 1251 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 YBR062CYBR062C 543 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 YPR014CYPR014C 330 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 SUS1YBR111W-A 291 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 GEA1YJR031C 4227 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 ALY1YKR021W 2748 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 YLR446WYLR446W 1302 nt2.67□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 ESL1YIL151C 3357 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 FLO11YIR019C 4104 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 NOP19YGR251W 591 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 LIN1YHR156C 1023 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 TDA8YAL064C-A 381 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 NYV1YLR093C 762 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 CWC24YLR323C 780 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 YRO2YBR054W 1035 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 YBR287WYBR287W 1284 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 YLR278CYLR278C 4026 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 GCD10YNL062C 1437 nt2.66□□□□□ -1.98
RPN5Q12250 NTF2YER009W 378 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 PNC1YGL037C 651 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 RPL27AYHR010W 411 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YOL134CYOL134C 390 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 RLF2YPR018W 1821 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YOR296WYOR296W 3870 nt2.65□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 PBS2YJL128C 2007 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 SHS1YDL225W 1656 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YDR209CYDR209C 414 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YER158W-AYER158W-A 216 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YGR053CYGR053C 852 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 VPS63YLR261C 327 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 COQ10YOL008W 624 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 BRX1YOL077C 876 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 CBP6YBR120C 489 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YBT1YLL048C 4986 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 COG3YER157W 2406 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 SIP3YNL257C 3690 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 DNL4YOR005C 2835 nt2.64□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 SRB8YCR081W 4284 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 BFR1YOR198C 1413 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YCR090CYCR090C 549 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YGL109WYGL109W 324 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YHR213WYHR213W 597 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YIL174WYIL174W 228 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 RPL17BYJL177W 555 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YPT52YKR014C 705 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YAR062WYAR062W 597 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YML037CYML037C 1023 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 MRPL33YMR286W 261 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YAP7YOL028C 738 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 GRX5YPL059W 453 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 POP7YBR167C 423 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 CDC20YGL116W 1833 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 IKI3YLR384C 4050 nt2.63□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 MES1YGR264C 2256 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 snR83snR83 306 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 JIP3YLR331C 378 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 FPR1YNL135C 345 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 ATG3YNR007C 933 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 MSN1YOL116W 1149 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YBR051WYBR051W 351 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 SLM4YBR077C 489 nt2.62□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 CAF120YNL278W 3183 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 RLI1YDR091C 1827 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 BNR1YIL159W 4128 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 snR76snR76 109 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 SPO11YHL022C 1197 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 RPS16AYMR143W 432 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 ESF2YNR054C 951 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 SFM1YOR021C 642 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 ISU1YPL135W 498 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 NPR3YHL023C 3441 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 SUL1YBR294W 2580 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 PUF4YGL014W 2667 nt2.61□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 ESC1YMR219W 4977 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 YER189WYER189W 369 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 ASG7YJL170C 630 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 COA4YLR218C 453 nt2.6□□□□□ -1.99
RPN5Q12250 COX8YLR395C 237 nt2.6□□□□□ -1.99
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