Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb41P48193 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb41P48193 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Epb41P48193 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb41P48193 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb41P48193 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb41P48193 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb41P48193 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb41P48193 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb41P48193 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb41P48193 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Epb41P48193 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms