Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Knop1Q9Z2Q2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Knop1Q9Z2Q2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms