Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc1bQ9WV32 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc1bQ9WV32 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc1bQ9WV32 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arpc1bQ9WV32 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arpc1bQ9WV32 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arpc1bQ9WV32 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arpc1bQ9WV32 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arpc1bQ9WV32 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arpc1bQ9WV32 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arpc1bQ9WV32 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arpc1bQ9WV32 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc1bQ9WV32 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms