Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sh3bgrlQ9JJU8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Sh3bgrlQ9JJU8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sh3bgrlQ9JJU8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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