Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sntg1Q925E1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms