Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrrc1Q80VQ1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lrrc1Q80VQ1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms