Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
WhammQ571B6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
WhammQ571B6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms