Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Siah2Q06986 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Siah2Q06986 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms