Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb41P48193 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Epb41P48193 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb41P48193 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb41P48193 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms