Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CratP47934 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CratP47934 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CratP47934 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CratP47934 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CratP47934 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CratP47934 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CratP47934 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CratP47934 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CratP47934 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CratP47934 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CratP47934 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CratP47934 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CratP47934 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CratP47934 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CratP47934 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CratP47934 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CratP47934 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CratP47934 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CratP47934 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CratP47934 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CratP47934 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CratP47934 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CratP47934 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CratP47934 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CratP47934 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CratP47934 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CratP47934 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CratP47934 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CratP47934 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CratP47934 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CratP47934 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CratP47934 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CratP47934 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CratP47934 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CratP47934 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CratP47934 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CratP47934 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CratP47934 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CratP47934 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CratP47934 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CratP47934 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CratP47934 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CratP47934 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CratP47934 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CratP47934 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CratP47934 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CratP47934 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CratP47934 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CratP47934 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CratP47934 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CratP47934 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CratP47934 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CratP47934 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CratP47934 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CratP47934 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CratP47934 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CratP47934 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CratP47934 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CratP47934 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CratP47934 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CratP47934 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CratP47934 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CratP47934 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CratP47934 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CratP47934 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CratP47934 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CratP47934 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CratP47934 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CratP47934 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CratP47934 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CratP47934 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CratP47934 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CratP47934 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CratP47934 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CratP47934 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CratP47934 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CratP47934 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CratP47934 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms