Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spi1P17433 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spi1P17433 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spi1P17433 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Spi1P17433 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spi1P17433 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spi1P17433 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms