Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Six6Q9QZ28 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Six6Q9QZ28 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms