Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Stx12Q9ER00 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Stx12Q9ER00 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms