Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933402E13RikQ9D4D2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933402E13RikQ9D4D2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933402E13RikQ9D4D2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933402E13RikQ9D4D2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933402E13RikQ9D4D2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933402E13RikQ9D4D2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933402E13RikQ9D4D2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
4933402E13RikQ9D4D2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms