Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gadd45gip1Q9CR59 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gadd45gip1Q9CR59 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gadd45gip1Q9CR59 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gadd45gip1Q9CR59 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gadd45gip1Q9CR59 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gadd45gip1Q9CR59 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gadd45gip1Q9CR59 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gadd45gip1Q9CR59 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gadd45gip1Q9CR59 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gadd45gip1Q9CR59 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gadd45gip1Q9CR59 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gadd45gip1Q9CR59 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gadd45gip1Q9CR59 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gadd45gip1Q9CR59 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gadd45gip1Q9CR59 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gadd45gip1Q9CR59 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms