Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim3Q99PE5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim3Q99PE5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms