Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sntg1Q925E1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sntg1Q925E1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms