Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ubqln3Q8C5U9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubqln3Q8C5U9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms