Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc30Q8BVF4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc30Q8BVF4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.3 ms