Protein–RNA interactions for Protein: Q6RKD8

Flrt1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flrt1Q6RKD8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Flrt1Q6RKD8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Flrt1Q6RKD8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms