Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Lrrn2Q6PHP6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Lrrn2Q6PHP6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Lrrn2Q6PHP6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms