Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Smchd1Q6P5D8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smchd1Q6P5D8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Smchd1Q6P5D8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smchd1Q6P5D8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smchd1Q6P5D8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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