Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chil3O35744 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chil3O35744 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chil3O35744 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chil3O35744 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chil3O35744 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chil3O35744 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chil3O35744 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chil3O35744 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chil3O35744 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chil3O35744 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chil3O35744 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chil3O35744 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chil3O35744 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chil3O35744 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Chil3O35744 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms