Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sec22cQ8BXT9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sec22cQ8BXT9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms