Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxa10P31310 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxa10P31310 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms