Protein–RNA interactions for Protein: P25118

Tnfrsf1a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1aP25118 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tnfrsf1aP25118 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tnfrsf1aP25118 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms