Protein–RNA interactions for Protein: Q60753

Ctf1, Cardiotrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctf1Q60753 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctf1Q60753 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ctf1Q60753 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms