Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

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Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Defb1P56386 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defb1P56386 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defb1P56386 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defb1P56386 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defb1P56386 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defb1P56386 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defb1P56386 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defb1P56386 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defb1P56386 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defb1P56386 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defb1P56386 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defb1P56386 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defb1P56386 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defb1P56386 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defb1P56386 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Defb1P56386 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defb1P56386 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Defb1P56386 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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