Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Acvr1P37172 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acvr1P37172 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acvr1P37172 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acvr1P37172 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acvr1P37172 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acvr1P37172 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acvr1P37172 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acvr1P37172 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acvr1P37172 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acvr1P37172 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acvr1P37172 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Acvr1P37172 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acvr1P37172 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Acvr1P37172 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acvr1P37172 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Acvr1P37172 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms