Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmb9P28076 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Psmb9P28076 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms