Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dll3O88516 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dll3O88516 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dll3O88516 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dll3O88516 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dll3O88516 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dll3O88516 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dll3O88516 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dll3O88516 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dll3O88516 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dll3O88516 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms