Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cacna1iE9Q7P2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1iE9Q7P2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms