Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrit3W8DXL4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrit3W8DXL4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrit3W8DXL4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit3W8DXL4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lrit3W8DXL4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lrit3W8DXL4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lrit3W8DXL4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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