Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP8

Vmn1r10, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r10W4VSP8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r10W4VSP8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r10W4VSP8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r10W4VSP8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r10W4VSP8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r10W4VSP8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r10W4VSP8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r10W4VSP8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r10W4VSP8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r10W4VSP8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r10W4VSP8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r10W4VSP8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r10W4VSP8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r10W4VSP8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r10W4VSP8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r10W4VSP8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r10W4VSP8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r10W4VSP8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r10W4VSP8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r10W4VSP8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r10W4VSP8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r10W4VSP8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r10W4VSP8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r10W4VSP8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r10W4VSP8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn1r10W4VSP8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r10W4VSP8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r10W4VSP8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r10W4VSP8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r10W4VSP8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r10W4VSP8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r10W4VSP8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn1r10W4VSP8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn1r10W4VSP8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r10W4VSP8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r10W4VSP8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r10W4VSP8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r10W4VSP8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn1r10W4VSP8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn1r10W4VSP8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r10W4VSP8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r10W4VSP8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r10W4VSP8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r10W4VSP8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r10W4VSP8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r10W4VSP8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r10W4VSP8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r10W4VSP8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r10W4VSP8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r10W4VSP8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r10W4VSP8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r10W4VSP8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vmn1r10W4VSP8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r10W4VSP8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r10W4VSP8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r10W4VSP8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vmn1r10W4VSP8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r10W4VSP8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r10W4VSP8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r10W4VSP8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vmn1r10W4VSP8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vmn1r10W4VSP8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms