Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gria4Q9Z2W8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gria4Q9Z2W8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gria4Q9Z2W8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gria4Q9Z2W8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gria4Q9Z2W8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gria4Q9Z2W8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gria4Q9Z2W8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gria4Q9Z2W8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gria4Q9Z2W8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gria4Q9Z2W8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gria4Q9Z2W8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gria4Q9Z2W8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gria4Q9Z2W8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gria4Q9Z2W8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gria4Q9Z2W8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gria4Q9Z2W8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gria4Q9Z2W8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gria4Q9Z2W8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gria4Q9Z2W8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gria4Q9Z2W8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gria4Q9Z2W8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gria4Q9Z2W8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gria4Q9Z2W8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gria4Q9Z2W8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gria4Q9Z2W8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gria4Q9Z2W8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gria4Q9Z2W8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gria4Q9Z2W8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gria4Q9Z2W8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gria4Q9Z2W8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gria4Q9Z2W8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gria4Q9Z2W8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gria4Q9Z2W8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gria4Q9Z2W8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gria4Q9Z2W8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gria4Q9Z2W8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gria4Q9Z2W8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gria4Q9Z2W8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gria4Q9Z2W8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gria4Q9Z2W8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gria4Q9Z2W8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gria4Q9Z2W8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gria4Q9Z2W8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gria4Q9Z2W8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gria4Q9Z2W8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gria4Q9Z2W8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gria4Q9Z2W8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gria4Q9Z2W8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gria4Q9Z2W8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gria4Q9Z2W8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gria4Q9Z2W8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gria4Q9Z2W8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gria4Q9Z2W8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gria4Q9Z2W8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gria4Q9Z2W8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gria4Q9Z2W8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gria4Q9Z2W8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gria4Q9Z2W8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gria4Q9Z2W8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gria4Q9Z2W8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gria4Q9Z2W8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gria4Q9Z2W8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gria4Q9Z2W8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gria4Q9Z2W8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gria4Q9Z2W8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gria4Q9Z2W8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gria4Q9Z2W8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gria4Q9Z2W8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gria4Q9Z2W8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gria4Q9Z2W8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gria4Q9Z2W8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gria4Q9Z2W8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gria4Q9Z2W8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gria4Q9Z2W8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gria4Q9Z2W8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gria4Q9Z2W8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gria4Q9Z2W8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Gria4Q9Z2W8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gria4Q9Z2W8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gria4Q9Z2W8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gria4Q9Z2W8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gria4Q9Z2W8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gria4Q9Z2W8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gria4Q9Z2W8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gria4Q9Z2W8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gria4Q9Z2W8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gria4Q9Z2W8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gria4Q9Z2W8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gria4Q9Z2W8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gria4Q9Z2W8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gria4Q9Z2W8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gria4Q9Z2W8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gria4Q9Z2W8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gria4Q9Z2W8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gria4Q9Z2W8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gria4Q9Z2W8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gria4Q9Z2W8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gria4Q9Z2W8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gria4Q9Z2W8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms