Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2N8

Actl6a, Actin-like protein 6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actl6aQ9Z2N8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Actl6aQ9Z2N8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actl6aQ9Z2N8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Actl6aQ9Z2N8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Actl6aQ9Z2N8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actl6aQ9Z2N8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actl6aQ9Z2N8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Actl6aQ9Z2N8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Actl6aQ9Z2N8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Actl6aQ9Z2N8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Actl6aQ9Z2N8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actl6aQ9Z2N8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actl6aQ9Z2N8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actl6aQ9Z2N8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Actl6aQ9Z2N8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actl6aQ9Z2N8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Actl6aQ9Z2N8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actl6aQ9Z2N8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Actl6aQ9Z2N8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actl6aQ9Z2N8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actl6aQ9Z2N8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actl6aQ9Z2N8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actl6aQ9Z2N8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actl6aQ9Z2N8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actl6aQ9Z2N8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actl6aQ9Z2N8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actl6aQ9Z2N8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actl6aQ9Z2N8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actl6aQ9Z2N8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actl6aQ9Z2N8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actl6aQ9Z2N8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actl6aQ9Z2N8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actl6aQ9Z2N8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actl6aQ9Z2N8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actl6aQ9Z2N8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Actl6aQ9Z2N8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Actl6aQ9Z2N8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actl6aQ9Z2N8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actl6aQ9Z2N8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actl6aQ9Z2N8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Actl6aQ9Z2N8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Actl6aQ9Z2N8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actl6aQ9Z2N8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actl6aQ9Z2N8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actl6aQ9Z2N8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Actl6aQ9Z2N8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Actl6aQ9Z2N8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actl6aQ9Z2N8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Actl6aQ9Z2N8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actl6aQ9Z2N8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Actl6aQ9Z2N8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Actl6aQ9Z2N8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actl6aQ9Z2N8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Actl6aQ9Z2N8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Actl6aQ9Z2N8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Actl6aQ9Z2N8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actl6aQ9Z2N8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actl6aQ9Z2N8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Actl6aQ9Z2N8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actl6aQ9Z2N8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actl6aQ9Z2N8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actl6aQ9Z2N8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Actl6aQ9Z2N8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Actl6aQ9Z2N8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actl6aQ9Z2N8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actl6aQ9Z2N8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actl6aQ9Z2N8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Actl6aQ9Z2N8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actl6aQ9Z2N8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actl6aQ9Z2N8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actl6aQ9Z2N8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Actl6aQ9Z2N8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Actl6aQ9Z2N8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Actl6aQ9Z2N8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actl6aQ9Z2N8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actl6aQ9Z2N8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Actl6aQ9Z2N8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Actl6aQ9Z2N8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Actl6aQ9Z2N8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actl6aQ9Z2N8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Actl6aQ9Z2N8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actl6aQ9Z2N8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actl6aQ9Z2N8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Actl6aQ9Z2N8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actl6aQ9Z2N8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Actl6aQ9Z2N8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actl6aQ9Z2N8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Actl6aQ9Z2N8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Actl6aQ9Z2N8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actl6aQ9Z2N8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Actl6aQ9Z2N8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actl6aQ9Z2N8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Actl6aQ9Z2N8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Actl6aQ9Z2N8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Actl6aQ9Z2N8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Actl6aQ9Z2N8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Actl6aQ9Z2N8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actl6aQ9Z2N8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actl6aQ9Z2N8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Actl6aQ9Z2N8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms