Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D7

Mbd4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd4Q9Z2D7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mbd4Q9Z2D7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mbd4Q9Z2D7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mbd4Q9Z2D7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mbd4Q9Z2D7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mbd4Q9Z2D7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mbd4Q9Z2D7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mbd4Q9Z2D7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mbd4Q9Z2D7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mbd4Q9Z2D7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mbd4Q9Z2D7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mbd4Q9Z2D7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mbd4Q9Z2D7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mbd4Q9Z2D7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mbd4Q9Z2D7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Mbd4Q9Z2D7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mbd4Q9Z2D7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mbd4Q9Z2D7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mbd4Q9Z2D7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd4Q9Z2D7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd4Q9Z2D7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mbd4Q9Z2D7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd4Q9Z2D7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd4Q9Z2D7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd4Q9Z2D7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mbd4Q9Z2D7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mbd4Q9Z2D7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mbd4Q9Z2D7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mbd4Q9Z2D7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mbd4Q9Z2D7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd4Q9Z2D7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mbd4Q9Z2D7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd4Q9Z2D7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd4Q9Z2D7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd4Q9Z2D7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mbd4Q9Z2D7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd4Q9Z2D7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd4Q9Z2D7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mbd4Q9Z2D7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mbd4Q9Z2D7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd4Q9Z2D7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd4Q9Z2D7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mbd4Q9Z2D7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd4Q9Z2D7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mbd4Q9Z2D7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd4Q9Z2D7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd4Q9Z2D7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd4Q9Z2D7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mbd4Q9Z2D7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mbd4Q9Z2D7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd4Q9Z2D7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd4Q9Z2D7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd4Q9Z2D7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Mbd4Q9Z2D7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd4Q9Z2D7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Mbd4Q9Z2D7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd4Q9Z2D7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd4Q9Z2D7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd4Q9Z2D7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mbd4Q9Z2D7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd4Q9Z2D7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd4Q9Z2D7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mbd4Q9Z2D7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd4Q9Z2D7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd4Q9Z2D7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mbd4Q9Z2D7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd4Q9Z2D7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd4Q9Z2D7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mbd4Q9Z2D7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mbd4Q9Z2D7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mbd4Q9Z2D7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mbd4Q9Z2D7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mbd4Q9Z2D7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Mbd4Q9Z2D7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mbd4Q9Z2D7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mbd4Q9Z2D7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd4Q9Z2D7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd4Q9Z2D7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd4Q9Z2D7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mbd4Q9Z2D7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mbd4Q9Z2D7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mbd4Q9Z2D7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mbd4Q9Z2D7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mbd4Q9Z2D7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mbd4Q9Z2D7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mbd4Q9Z2D7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mbd4Q9Z2D7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mbd4Q9Z2D7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mbd4Q9Z2D7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mbd4Q9Z2D7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mbd4Q9Z2D7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mbd4Q9Z2D7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd4Q9Z2D7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mbd4Q9Z2D7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mbd4Q9Z2D7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mbd4Q9Z2D7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mbd4Q9Z2D7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mbd4Q9Z2D7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mbd4Q9Z2D7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mbd4Q9Z2D7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms