Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NfkbiaQ9Z1E3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NfkbiaQ9Z1E3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfkbiaQ9Z1E3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NfkbiaQ9Z1E3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbiaQ9Z1E3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbiaQ9Z1E3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbiaQ9Z1E3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NfkbiaQ9Z1E3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbiaQ9Z1E3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbiaQ9Z1E3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbiaQ9Z1E3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbiaQ9Z1E3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbiaQ9Z1E3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NfkbiaQ9Z1E3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NfkbiaQ9Z1E3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfkbiaQ9Z1E3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfkbiaQ9Z1E3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NfkbiaQ9Z1E3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NfkbiaQ9Z1E3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NfkbiaQ9Z1E3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfkbiaQ9Z1E3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfkbiaQ9Z1E3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfkbiaQ9Z1E3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbiaQ9Z1E3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfkbiaQ9Z1E3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbiaQ9Z1E3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NfkbiaQ9Z1E3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfkbiaQ9Z1E3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfkbiaQ9Z1E3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfkbiaQ9Z1E3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfkbiaQ9Z1E3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbiaQ9Z1E3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NfkbiaQ9Z1E3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfkbiaQ9Z1E3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NfkbiaQ9Z1E3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NfkbiaQ9Z1E3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NfkbiaQ9Z1E3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NfkbiaQ9Z1E3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NfkbiaQ9Z1E3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NfkbiaQ9Z1E3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfkbiaQ9Z1E3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NfkbiaQ9Z1E3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NfkbiaQ9Z1E3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfkbiaQ9Z1E3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfkbiaQ9Z1E3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NfkbiaQ9Z1E3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NfkbiaQ9Z1E3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NfkbiaQ9Z1E3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NfkbiaQ9Z1E3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfkbiaQ9Z1E3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfkbiaQ9Z1E3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfkbiaQ9Z1E3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NfkbiaQ9Z1E3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NfkbiaQ9Z1E3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfkbiaQ9Z1E3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfkbiaQ9Z1E3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NfkbiaQ9Z1E3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NfkbiaQ9Z1E3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NfkbiaQ9Z1E3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms