Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L3

Oc90, Otoconin-90, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oc90Q9Z0L3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Oc90Q9Z0L3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Oc90Q9Z0L3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Oc90Q9Z0L3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Oc90Q9Z0L3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Oc90Q9Z0L3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Oc90Q9Z0L3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Oc90Q9Z0L3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Oc90Q9Z0L3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Oc90Q9Z0L3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Oc90Q9Z0L3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Oc90Q9Z0L3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Oc90Q9Z0L3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Oc90Q9Z0L3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Oc90Q9Z0L3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Oc90Q9Z0L3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Oc90Q9Z0L3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Oc90Q9Z0L3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Oc90Q9Z0L3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Oc90Q9Z0L3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Oc90Q9Z0L3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Oc90Q9Z0L3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Oc90Q9Z0L3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Oc90Q9Z0L3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Oc90Q9Z0L3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Oc90Q9Z0L3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Oc90Q9Z0L3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Oc90Q9Z0L3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Oc90Q9Z0L3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Oc90Q9Z0L3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Oc90Q9Z0L3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Oc90Q9Z0L3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Oc90Q9Z0L3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Oc90Q9Z0L3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Oc90Q9Z0L3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Oc90Q9Z0L3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Oc90Q9Z0L3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Oc90Q9Z0L3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Oc90Q9Z0L3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Oc90Q9Z0L3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Oc90Q9Z0L3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Oc90Q9Z0L3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Oc90Q9Z0L3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Oc90Q9Z0L3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Oc90Q9Z0L3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Oc90Q9Z0L3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Oc90Q9Z0L3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Oc90Q9Z0L3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Oc90Q9Z0L3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Oc90Q9Z0L3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Oc90Q9Z0L3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Oc90Q9Z0L3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Oc90Q9Z0L3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Oc90Q9Z0L3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Oc90Q9Z0L3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Oc90Q9Z0L3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Oc90Q9Z0L3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Oc90Q9Z0L3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Oc90Q9Z0L3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Oc90Q9Z0L3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Oc90Q9Z0L3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Oc90Q9Z0L3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Oc90Q9Z0L3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Oc90Q9Z0L3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Oc90Q9Z0L3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Oc90Q9Z0L3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Oc90Q9Z0L3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Oc90Q9Z0L3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Oc90Q9Z0L3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Oc90Q9Z0L3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Oc90Q9Z0L3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Oc90Q9Z0L3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Oc90Q9Z0L3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Oc90Q9Z0L3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Oc90Q9Z0L3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Oc90Q9Z0L3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Oc90Q9Z0L3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Oc90Q9Z0L3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Oc90Q9Z0L3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Oc90Q9Z0L3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Oc90Q9Z0L3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Oc90Q9Z0L3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Oc90Q9Z0L3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Oc90Q9Z0L3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Oc90Q9Z0L3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Oc90Q9Z0L3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Oc90Q9Z0L3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Oc90Q9Z0L3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Oc90Q9Z0L3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Oc90Q9Z0L3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Oc90Q9Z0L3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Oc90Q9Z0L3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Oc90Q9Z0L3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Oc90Q9Z0L3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Oc90Q9Z0L3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Oc90Q9Z0L3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Oc90Q9Z0L3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Oc90Q9Z0L3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Oc90Q9Z0L3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Oc90Q9Z0L3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms